Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN1P35523 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLCN1P35523 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms