Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJA4P35212 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA4P35212 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA4P35212 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA4P35212 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA4P35212 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA4P35212 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA4P35212 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA4P35212 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA4P35212 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA4P35212 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms