Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms