Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP2C19P33261 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP2C19P33261 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP2C19P33261 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms