Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC8P31273 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC8P31273 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms