Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA9P31269 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA9P31269 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms