Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA7P31268 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA7P31268 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA7P31268 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms