Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD27P26842 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD27P26842 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD27P26842 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD27P26842 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD27P26842 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD27P26842 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD27P26842 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD27P26842 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD27P26842 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD27P26842 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD27P26842 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD27P26842 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD27P26842 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD27P26842 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD27P26842 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD27P26842 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms