Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IVDP26440 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IVDP26440 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IVDP26440 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IVDP26440 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IVDP26440 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IVDP26440 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IVDP26440 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IVDP26440 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IVDP26440 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IVDP26440 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IVDP26440 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IVDP26440 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IVDP26440 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IVDP26440 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IVDP26440 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IVDP26440 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IVDP26440 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IVDP26440 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms