Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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