Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGFR3P22607 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms