Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EPHA1P21709 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms