Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP3P21580 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP3P21580 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms