Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK11BP21127 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms