Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH2P19022 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH2P19022 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH2P19022 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH2P19022 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH2P19022 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH2P19022 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH2P19022 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH2P19022 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms