Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STMN1P16949 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STMN1P16949 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STMN1P16949 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STMN1P16949 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STMN1P16949 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STMN1P16949 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STMN1P16949 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STMN1P16949 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms