Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3L1P16619 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms