Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA1P14867 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA1P14867 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms