Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A1P13866 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms