Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLS3P13797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLS3P13797 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLS3P13797 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLS3P13797 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS3P13797 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS3P13797 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS3P13797 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS3P13797 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS3P13797 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS3P13797 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS3P13797 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS3P13797 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS3P13797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS3P13797 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms