Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT10P13645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT10P13645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT10P13645 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT10P13645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT10P13645 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT10P13645 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT10P13645 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT10P13645 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT10P13645 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms