Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN1P12814 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms