Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOP2AP11388 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
TOP2AP11388 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms