Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HKR1P10072 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HKR1P10072 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HKR1P10072 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HKR1P10072 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms