Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GLI3P10071 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GLI3P10071 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GLI3P10071 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GLI3P10071 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GLI3P10071 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GLI3P10071 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GLI3P10071 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
GLI3P10071 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
GLI3P10071 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GLI3P10071 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GLI3P10071 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GLI3P10071 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GLI3P10071 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms