Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM200BP0CF97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM200BP0CF97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms