Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA4P06727 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA4P06727 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA4P06727 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA4P06727 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA4P06727 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA4P06727 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA4P06727 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA4P06727 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA4P06727 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA4P06727 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA4P06727 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms