Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SERPIND1P05546 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERPIND1P05546 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms