Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGF1P05230 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGF1P05230 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGF1P05230 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGF1P05230 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGF1P05230 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGF1P05230 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGF1P05230 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGF1P05230 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGF1P05230 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms