Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB4AP04350 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms