Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHG1P01857 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms