Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA5P01569 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA5P01569 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms