Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SEC24BO95487 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24BO95487 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24BO95487 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24BO95487 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24BO95487 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24BO95487 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24BO95487 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEC24BO95487 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms