Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB11O95342 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms