Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP3O75386 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TULP3O75386 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TULP3O75386 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TULP3O75386 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP3O75386 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP3O75386 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP3O75386 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP3O75386 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP3O75386 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP3O75386 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms