Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP3O75154 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms