Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG3O60359 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms