Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL3O43909 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms