Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms