Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH3O43739 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH3O43739 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms