Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATCO43716 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GATCO43716 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GATCO43716 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GATCO43716 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GATCO43716 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GATCO43716 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GATCO43716 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GATCO43716 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GATCO43716 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GATCO43716 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GATCO43716 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms