Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN6O43657 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN6O43657 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms