Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMM44O43615 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms