Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID2O43424 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID2O43424 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID2O43424 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID2O43424 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID2O43424 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID2O43424 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID2O43424 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRID2O43424 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRID2O43424 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID2O43424 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID2O43424 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms