Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COCHO43405 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COCHO43405 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COCHO43405 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COCHO43405 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COCHO43405 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COCHO43405 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COCHO43405 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COCHO43405 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COCHO43405 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COCHO43405 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COCHO43405 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms