Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIPK2O43353 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms