Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SART1O43290 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SART1O43290 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SART1O43290 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SART1O43290 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SART1O43290 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SART1O43290 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SART1O43290 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SART1O43290 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SART1O43290 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SART1O43290 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SART1O43290 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SART1O43290 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SART1O43290 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms