Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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