Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms