Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLOCKO15516 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLOCKO15516 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLOCKO15516 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLOCKO15516 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLOCKO15516 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLOCKO15516 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLOCKO15516 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms